| 中枢神经系统（CNS）感染可由真菌、细菌、病毒等病原体引起，具有起病急、进展快、病原体复杂等特点，存在较高的致残、致死风险。CNS感染的早期诊断，对于及时控制感染、提高患者的生存率尤为重要。但是目前CNS感染的早期诊断存在很大困难，一方面，患者临床症状和脑脊液生化指标非特异，另一方面，影像学检查依赖于CT或MRI，甚至需要增强扫描，这些检查不易捕捉到早期炎性改变的影像学特征。而且，传统的脑脊液细菌学培养阳性率不高，低于40%。由于能够透过血脑屏障或在脑脊液中达到较高浓度的抗菌药不多，在无病原学证据支持的情况下，如何经验性应用抗菌药也是困扰临床医生的问题。
mNGS可以检测所有已知基因序列的病原体，无偏倚地检出样本中的病原体，灵敏度及特异度高，检测速度相对较快。因此，推荐对于病因不明，经验治疗效果不佳，重症，免疫缺陷或免疫抑制的脑炎、脑膜炎和脑脓肿患者，应在常规病原检测基础上，尽早使用mNGS检测辅助明确病原体。虽然，脑脊液mNGS技术已经逐步应用于CNS感染病原体诊断方面，但作为一种新兴的病原诊断方法，mNGS操作流程较为复杂，涉及标本采集，核酸提取，文库准备，序列测序，生信分析，质控等多方面实验操作，目前仍缺乏相关的应用标准。因此，设立CNS感染病原体mNGS测序性能要求、检测流程、质量控制和安全防护等方面应用指南尤为重要。 |
